Været er sannsynligvis en faktor når du planlegger en tur til Nakatsugawa, så husk at det vanligvis er billigst når været ikke er på topp. De varmeste månedene er vanligvis august og juli, med en gjennomsnittstemperatur på 20 °C, og de kaldeste månedene er januar og februar, med en gjennomsnittstemperatur på 1 °C. De mest regnfulle månedene i Nakatsugawa er juli, juni, september og august. I løpet av denne perioden regner det i snitt 337 mm hver måned.