Det beste området å bo på Morotai-øya er Daruba, øyas hovedby på sørvestkysten.Daruba er Morotais administrative og kommersielle sentrum, og tilbyr den mest utviklede infrastrukturen og overnattingsmulighetene. Her finner du et utvalg av gjestehus og noen større hoteller, sammen med lokale spisesteder og markeder. Byen er også hovedinnfallsporten til øya, med fergeterminalen og flyplassen i nærheten.Par som søker bekvemmelighet og tilgang til lokalt liv, vil finne Daruba passende. Det er enkelt å arrangere øyturer, dykkeutflukter og transport til andre deler av Morotai herfra. Det lokale markedet gir et innblikk i dagliglivet på øya, og det er flere små strender like utenfor byen for avslapning.For de som søker en mer avsidesliggende og rolig opplevelse, spesielt for alenereisende eller par som ønsker å slappe av, tilbyr områder litt utenfor Daruba, som de nær Tanjung Dehegila, et roligere alternativ.