Det beste området å bo i Karimun Jawa er Karimunjawa Town, som er hovedbosetningen på øya.Karimunjawa Town er der de fleste av øyas fasiliteter ligger. Her finner du hovedhavnen, der ferger og hurtigbåter ankommer, sammen med de fleste restauranter, butikker og gjestehus. Selve byen er relativt liten og kan utforskes til fots, med de fleste aktivitetene sentrert rundt hovedtorget og området nær havnen. Den fungerer som et sentralt knutepunkt for å utforske resten av skjærgården.For reisende som leter etter bekvemmelighet og enkel tilgang til fasiliteter, er Karimunjawa Town et utmerket valg. Det er ideelt for de som foretrekker å ha spisemuligheter og grunnleggende tjenester innen gangavstand, og det tilbyr det beste utvalget av overnatting, fra budsjettvennlige gjestehus til mer komfortable hoteller. Dette området er også flott for å arrangere øyhoppingsturer eller dykkeutflukter, da de fleste operatørene holder til her.Par som søker en mer avsidesliggende opplevelse kan vurdere overnatting rett utenfor Karimunjawa Town, spesielt langs kysten mot vest eller nord. Disse områdene har ofte feriesteder eller bungalower med privat strandtilgang eller havutsikt, og tilbyr en roligere setting samtidig som de er en kort scootertur eller taxitur fra byens fasiliteter.