De varmeste månedene er vanligvis oktober og mai, med en gjennomsnittstemperatur på 27 °C, og de kaldeste månedene er august og juli, med en gjennomsnittstemperatur på 26 °C. De mest regnfulle månedene i Bintuni er april, mars, januar og desember. I løpet av denne perioden regner det i snitt 381 mm hver måned.