Været har mest sannsynlig litt å si når du planlegger en tur til Barnaul, så husk at været ikke alltid er på topp i de rimeligste reiseperiodene. De varmeste månedene er vanligvis juli og juni, med en gjennomsnittstemperatur på 18 °C, og de kaldeste månedene er januar og februar, med en gjennomsnittstemperatur på -12 °C. De mest snørike månedene i Barnaul er mars, februar, januar og desember. I løpet av denne perioden faller det i snitt 129 cm snø hver måned.