De beste områdene å bo i Yakushima er Miyanoura- og Anbo-regionene, spesielt for de som ønsker bekvemmelighet og tilgang til fasiliteter.Miyanoura, som ligger på øyas nordkyst, er hovedankomstpunktet for de fleste besøkende som kommer med ferge. Det er den største byen og har det bredeste utvalget av restauranter, butikker og overnattingsmuligheter. Her finner du Yakushima Environmental Culture Village Centre, som er et godt sted å samle informasjon og planlegge fotturene dine. Området rundt fergeterminalen og langs hovedveien, rute 594, tilbyr mange valg.Dette området er spesielt bra for familier på grunn av konsentrasjonen av fasiliteter. Å ha flere spisemuligheter og lett tilgjengelige butikker kan gjøre et opphold med barn mye smidigere. Nærheten til fergeterminalen forenkler også ankomster og avganger.Anbo, på øyas østkyst, tilbyr også et godt utvalg av overnatting og er en praktisk base for å utforske de sørlige og østlige delene av øya. Det er den nest største byen og gir god tilgang til populære turstier som de som fører til Jomon Sugi.For par som liker å gå turer, gir Anbo utmerket tilgang til mange stistartpunkter, noe som gjør det mulig å starte tidlig for å unngå folkemengdene.