Den beste tiden å besøke Sonoyta er i de kjøligere, tørrere månedene fra november til april.I disse månedene er dagtemperaturene behagelige, vanligvis mellom 20 °C og 28 °C, noe som gjør det ideelt for å utforske ørkenlandskapene rundt eller nyte utendørsaktiviteter. Denne perioden har også svært lite nedbør, noe som sikrer klar himmel for reiseplanene dine.For de som ønsker å unngå høysesongens folkemengder og potensielt finne bedre priser på overnatting, er senhøsten (november) og tidlig vår (april) utmerkede valg. Været er fortsatt veldig behagelig, men det er færre besøkende sammenlignet med høydepunktet om vinteren.Motsatt kan sommermånedene fra mai til oktober være ekstremt varme, med temperaturer som ofte overstiger 40 °C. Denne perioden gir også den største sjansen for regn, selv om nedbøren generelt er lav hele året.