De varmeste månedene er vanligvis juli og august, med en gjennomsnittstemperatur på 17 °C, og de kaldeste månedene er januar og februar, med en gjennomsnittstemperatur på -10 °C. De mest snørike månedene i Sekretarskiy er mars, januar, februar og desember. I løpet av denne perioden faller det i snitt 231 cm snø hver måned.