Det beste området å bo i Naxos by er området rundt gamlebyen og havnefronten, spesielt nær Portara (Apollontempelet) og slottet.Dette sentrale området er hjertet av Naxos by, og tilbyr en blanding av historisk sjarm og enkel tilgang til alt. Du finner en labyrint av trange, svingete gater under den venetianske borgen, fylt med små butikker, tavernaer og kafeer. Havnepromenaden, med restauranter og barer, strekker seg langs havnen og gir nydelig utsikt over havet og den ikoniske Portara i nordenden. De fleste hotellene her ligger i gangavstand fra hovedtorget, Plateia Protodikiou.Par som leter etter en romantisk og praktisk base, vil spesielt like å bo innenfor gamlebyens murer eller langs havnefronten. Dette gir mulighet for kveldsturer gjennom de sjarmerende smugene, nyte solnedgangen fra Portara, og enkel tilgang til et bredt utvalg av spisesteder. Mange boutiquehoteller ligger i historiske bygninger, og tilbyr et unikt opphold.For alenereisende er det ideelt å bo nær hovedhavneområdet og busstasjonen. Dette sikrer at du aldri er langt fra transportforbindelser for å utforske øyas strender og landsbyer, og det er alltid noe som skjer langs havnefronten, noe som gjør det enkelt å finne et sted å spise eller ta en drink.