Det beste området å bo i Mkoani er innenfor byen selv, spesielt nær havnen og dens umiddelbare omgivelser.Mkoani er en relativt liten havneby, og området rundt havnen er den mest utviklede delen for besøkende. Du finner hovedfergeterminalen her, sammen med noen få gjestehus og lokale spisesteder. Sentrum er gangavstand fra havnen, og tilbyr tilgang til grunnleggende butikker og lokale markeder.For alenereisende gir det å bo nær havnen bekvemmelighet for ankomst og avreise, samt enkel tilgang til lokale fasiliteter. Det er en praktisk base for å utforske den sørlige delen av Pemba Island, med transportmuligheter lett tilgjengelige for dagsturer.Par som ønsker et mer avslappet opphold, kan vurdere overnatting litt utenfor det umiddelbare havneområdet, men fortsatt innen lett rekkevidde av Mkoani.