De varmeste månedene er vanligvis juli og juni, med en gjennomsnittstemperatur på 12 °C, og de kaldeste månedene er januar og desember, med en gjennomsnittstemperatur på -25 °C. De mest snørike månedene i Jakutskij er januar, februar, desember og april. I løpet av denne perioden faller det i snitt 64 cm snø hver måned.