Den beste tiden å besøke Gobabeb er vanligvis i de kjøligere, tørrere månedene fra mai til oktober.
I denne perioden er temperaturene mer behagelige, vanligvis mellom 20-30°C om dagen, noe som gjør utendørsaktiviteter og ørkenutforskning mye mer behagelig. Himmelen er vanligvis klar, noe som gir utmerkede muligheter for stjernekikking, som er et høydepunkt ved et ørkenbesøk. Denne tørre årstiden betyr også mindre sjanse for å møte ekstreme værhendelser.
Denne tiden av året er spesielt bra for de som er interessert i vitenskapelig forskning eller utdanningsprogrammer, da det behagelige været tillater omfattende feltarbeid og utendørslæring uten ubehaget av intens varme. Dyrelivsobservasjon, selv om det er subtilt i ørkenen, kan også være mer givende ettersom dyr kan være mer aktive i de kjøligere delene av dagen.
For reisende som søker en rolig og fokusert opplevelse, kanskje for et retreat eller et spesialisert verksted, gir disse månedene ideelle forhold for konsentrasjon og glede av det unike ørkenmiljøet.