Akvariets temaer er Sagami-bukten og Stillehavet, det mangfoldige dyrelivet som finnes der, og hvordan alt liv henger sammen. Besøkende kan ha det gøy i akvariet samtidig som de lærer om havet og omgivelsene rundt det.

Når man kommer inn i Enoshima akvarium, vil besøkende se utstillinger som tar for seg Sagami-bukten, etterfulgt av utstillinger om dyphavet, maneter og havdyr. Akvariet tilbyr også ulike forklaringer, forestillinger og programmer som gir besøkende mulighet til å samhandle med havdyr. Besøkende oppfordres til å oppleve «overraskelse og spenning» og «helbredelse» gjennom disse aktivitetene. I tillegg arrangeres det også spennende sesongutstillinger og midlertidige arrangementer.