Elafonisi er en langstrakt øy, som ofte «brytes» i to deler av vann, noe som gir inntrykk av å være en separat øy og et «Natura 2000» beskyttet område. Øya er full av sanddyner med sandliljer og junipers (som cedertre). De truede skilpaddene Caretta-Caretta og flere sjeldne dyr hviler på øya, og det er strengt forbudt å fjerne noen planter, dyr fra området. Eksotisk strand med hvit sand og turkisfarget vann, som minner om Karibia, er dannet på begge sider av halvøya. Sanden er rosa på mange steder, og tar sin farge fra tusenvis av ødelagte skall. I nærheten av “brytepunktet” på halvøya, overstiger ikke vannet 1m, noe som skaper en liten lagune, ideell for barn.