Inasa-fjellet (稲 佐 山, Inasayama) er et 333 meter høyt fjell nær Nagasakis sentrum. Toppen kan nås med ropeway, buss eller bil, og tilbyr flott utsikt over byen. Faktisk er nattutsikten fra Mount Inasa rangert blant Japans tre beste nattutsikt i tillegg til utsikten fra Mount Hakodate og Mount Rokko. Flere TV- og radioantenner og et observasjonsdekke med restaurant ligger på toppen.

Glover Garden (グ ラ バ ー 園, Glover-en) er et friluftsmuseum i Nagasaki som viser herskapshus av flere av byens tidligere utenlandske innbyggere og beslektede bygninger. Det ligger på bakken der vestlige kjøpmenn slo seg ned etter slutten av Japans tilbaketrukkelses æra i andre halvdel av 1800-tallet. Hagenes største attraksjon er Former Glover House, den eldste trebygningen i vestlig stil i Japan. Thomas Glover (1838-1911) var en skotsk kjøpmann som flyttet til Nagasaki etter åpningen av havnen for utenrikshandel i 1859. Han hjalp senere noen av de revolusjonære som til slutt ville styrte Tokugawa Shogunate i Meiji-restaureringen. Glover er aktiv i forskjellige bransjer, inkludert skipsbygging og gruvedrift, og har en fremtredende rolle i den tidlige historien til Japans industrialisering.

Sofukuji Temple (崇 福寺, Sōfukuji) er et tempel i Nagasaki som tilhører Obaku-skolen til Zen-buddhismen. Tempelet ble opprinnelig bygget i 1629 for Nagasakis kinesiske innbyggere, og er konstruert i en kinesisk arkitektonisk stil og føles noe annerledes enn andre templer i Japan. Sofukuji er bygget langs en skråning. Nederst står tempelets to etasjer høye inngangsport, Ryugumon (lit. Gate of the Dragon Palace). Som resten av templet er det malt rød. Porten ble opprinnelig bygget i 1673, men ble ødelagt flere ganger av brann og uvær før den siste gjenoppbyggingen ble fullført i 1849.

Dejima (出 島) var en menneskeskapt øy i havnen i Nagasaki, konstruert i 1636 for å skille portugisiske innbyggere fra den japanske befolkningen og kontrollere deres misjonsvirksomhet. Noen år senere ble portugiserne utvist fra Japan, og den nederlandske handelsstasjonen, tidligere lokalisert i Hirado, ble flyttet til Dejima. Hollenderne ble begrenset til Dejima under Japans to århundrer med isolasjon som de eneste gjenværende vestlige tillatte i landet. I dag er Dejima ikke en øy lenger, da området rundt er blitt gjenvunnet på 1900-tallet. Imidlertid forblir eller er det rekonstruert en rekke av Dejimas historiske strukturer i området, inkludert forskjellige boliger, lager, murer og porter. Det endelige målet er å konvertere Dejima tilbake til en øy ved å grave kanaler rundt alle de fire sidene.

Urakami katedral (浦上天主堂, Urakami Tenshudō) er en katolsk kirke i Nagasaki med en tragisk men interessant historie. I dag er katedralen en fungerende kirke som ligger i en stor, europeisk stil, røde murstein bygning, og er hjemmet til ulike relikvier som overlevde atombombingen. Atombomben ble kastet på Nagasaki 9. august 1945 og nesten helt ødelagt kirken som sto bare 500 meter fra hypocentret. En gruppe brente steinhellige ble etterlatt på plass og står fremdeles foran en dekimert vegg foran katedralen. Det er også andre relikvier inne, inkludert det overlevende hodet på en statue av St. Mary som ble funnet etter eksplosjonen, og en av kirkens opprinnelige klokker. Den moderne inkarnasjonen av katedralen ble fullført i 1959.

Nagasaki museum for historie og kultur (長崎 歴 史 文化 博物館, Nagasaki Rekishi Bunka Hakubutsukan) er et godt gjennomført, moderne museum dedikert til Nagasakis historie som en av Japans største internasjonale handelshavner. Den ganske store, permanente utstillingen er spredt over to etasjer og består av forskjellige seksjoner, hver med fokus på en annen fasett av Nagasakis rike historie. I løpet av Edo-perioden adopterte den japanske regjeringen isolasjonisme, og effektivt avskåret landet fra resten av verden. På dette tidspunktet ble Nagasaki en av de eneste havnene der internasjonal handel var tillatt, nemlig med kinesere og nederlendere. Dette gjorde midlertidig byen Japans hovedvindu til omverdenen og lot en rik økonomi, kultur og historie blomstre.

Kofukuji-tempelet (興福寺, Kōfukuji) er det eldste og et av de viktigste kinesisk-funderte templene i Nagasaki. Ligger i byens Teramachi ("Temple Town") distrikt, er det fødestedet til Obaku-skolen til Zen-buddhismen i Japan og har mange interessante funksjoner. Tempelet ble opprettet rundt 1620 av en kinesisk munk i en tid da et stort antall kinesiske kjøpmenn kom til Nagasaki for å handle. Komplekset ble opprinnelig opprettet som et sted å be for trygge sjøreiser for kjøpmennene, og konstruksjonen er sterkt påvirket av kinesiske arkitektoniske stiler, noe som gjør at det føles annerledes enn andre templer i Japan. Tempelområdene inneholder en rekke bygninger, inkludert storsalen, opprinnelig bygget i 1632, som fungerer som et fint eksempel på datidens kinesisk stil. En berømt, stor glasslykt importert fra Kina, henger fra taket i hovedsalen. Det er forskjellige andre interessante haller og strukturer rundt eiendommen med forklarende skilt på engelsk.

Nagasaki Confucius Shrine (孔子 廟, Kōshi-byō) er en av bare en håndfull helligdommer viet til den ærverdige kinesiske filosofen Confucius i Japan. Helligdommen ble bygget i 1893 av Nagasakis kinesiske samfunn. Den fargerike, atmosfæriske helligdommen inneholder også et museum på baksiden av eiendommen. En liten hage med en bro og dam hilser besøkende ved inngangen. De utsmykkede bygningene i kinesisk stil er utsmykket med gule tak. De 72 vismennene, i livsstørrelse steinstatuer som veier rundt to tonn hver og skildrer Confucius ’disipler, flankerer rundt helligdomens gårdsplass. Helligdommen oppfordrer besøkende til å finne blant statuene en som ligner en slektning.

Oura-kirken (大浦天主堂, Ōura Tenshudō) er en katolsk kirke i Nagasaki. Bygget mot slutten av Edo-perioden i 1864 av en fransk misjonær for det voksende samfunnet av utenlandske handelsmenn i byen, regnes den som den eldste stående kristne kirken i Japan. Oura kirke er viet til minne om de 26 kristne som ble henrettet i byen i 1597. I dag står arbeiderkirken som et attraktivt eksempel på moderne europeisk arkitektur, og tiltrekker seg mange besøkende. Kirken var den første bygningen i vestlig stil i Japan som ble utpekt som en nasjonal skatt. Den stige inngangsavgiften inkluderer inngang til et museum om kristendommens historie i Japan. Ligger i attraktive gamle bygninger til høyre for kirken er det kristne museum.

Kofukuji-tempelet (興福寺, Kōfukuji) er det eldste og et av de viktigste kinesisk-funderte templene i Nagasaki. Ligger i byens Teramachi ("Temple Town") distrikt, er det fødestedet til Obaku-skolen til Zen-buddhismen i Japan og har mange interessante funksjoner. Tempelet ble opprettet rundt 1620 av en kinesisk munk i en tid da et stort antall kinesiske kjøpmenn kom til Nagasaki for å handle. Komplekset ble opprinnelig opprettet som et sted å be for trygge sjøreiser for kjøpmennene, og konstruksjonen er sterkt påvirket av kinesiske arkitektoniske stiler, noe som gjør at det føles annerledes enn andre templer i Japan.

Nagasaki Confucius Shrine (孔子 廟, Kōshi-byō) er en av bare en håndfull helligdommer viet til den ærverdige kinesiske filosofen Confucius i Japan. Helligdommen ble bygget i 1893 av Nagasakis kinesiske samfunn. Den fargerike, atmosfæriske helligdommen inneholder også et museum på baksiden av eiendommen. En liten hage med en bro og dam hilser besøkende ved inngangen. De utsmykkede bygningene i kinesisk stil er utsmykket med gule tak. De 72 vismennene, i livsstørrelse steinstatuer som veier rundt to tonn hver og skildrer Confucius ’disipler, flankerer rundt helligdomens gårdsplass. Helligdommen oppfordrer besøkende til å finne blant statuene en som ligner en slektning.

Oura Church (大 浦 天主堂, Ōura Tenshudō) er en katolsk kirke i Nagasaki. Bygget mot slutten av Edo-perioden i 1864 av en fransk misjonær for det voksende samfunnet av utenlandske kjøpmenn i byen, regnes det som den eldste stående kristne kirke i Japan. Oura kirke er viet til minnet om de 26 kristne som ble henrettet i byen i 1597. I dag står arbeiderkirken som et attraktivt eksempel på moderne europeisk arkitektur, og trekker mange besøkende. Kirken var den første bygningen i vestlig stil i Japan som ble utpekt som en nasjonal skatt. Den bratte adgangsavgiften inkluderer inngang til et museum om kristendommens historie i Japan. Christian Museum ligger i attraktive gamle bygninger til høyre for kirken. Inkludert i inngangsbilletten inneholder museet forskjellige utstillinger knyttet til historien til Oura kirke og kristendom i regionen og over hele Japan, med forskjellige gjenstander og gamle dokumenter utstilt. Forklaringer er overveiende på japansk.

Twenty Six Martyrs Monument og tilstøtende museum (二 十六 聖人 記念 館, Nijūroku Seijin Kinenkan) i Nagasaki er viet til de tjueseks kristne som ble henrettet her 5. februar 1597. De inkluderte både utenlandske misjonærer og japanske lekmenn. Misjonsvirksomhet var forbudt den gangen, og Japans hersker Toyotomi Hideyoshi iscenesatte henrettelsen som en advarsel. Monumentet ligger i en liten park på en høyde ikke langt fra Nagasaki stasjon og tilbyr fin utsikt over byen. En rett rød linje går fra monumentet over parkens plaza i retning av Oura-kirken på motsatt side av byen. Oura kirke er også dedikert til de 26 martyrene. Museet bak monumentet er viet til minnet om martyrene og til kristendommen i Japan generelt. Interiøret minner om en kirke med glassmalerier og sørger for atmosfærisk visning av utstillingene. På skjermen er gjenstander relatert til kristendommen i Japan, inkludert gamle dokumenter, statuer og smykker. Forklaringer på mange av stykkene er på engelsk.

Den nederlandske skråningen (オ ラ ン ダ 坂, Oranda-zaka) er en steinbelagt gate som fører opp en åsside i Nagasaki der mange utenlandske handelsmenn bodde etter åpningen av byens havn for utenrikshandel i 1859. Fordi nederlenderne var de eneste vestlendingene tillot seg i landet i de to foregående århundrer, "nederlendere" refererte til alt vestlig for en stund. Noen få tidligere boliger er fortsatt i området i dag. Blant dem er Higashi Yamate 13 åpen for publikum. Dette gamle huset i vestlig stil, som en gang var hjemmet til en velegnet europeisk familie, er godt bevart, med mye av de gamle møblene og romoppsettene som gjenstår. Det er en balkong ovenpå hvor du kan få fin utsikt over nærområdet. En kafé ligger i første etasje.

Meganebashi (眼鏡 橋, tent. Spectacles Bridge) er den mest bemerkelsesverdige av flere steinbroer som spenner over Nakashima-elven i sentrum av Nagasaki. Broen, som får navnet sitt fra likheten med et par briller når det gjenspeiles i elvevannet, er en populær turistattraksjon og er utpekt som en viktig kulturell eiendom. Broen ble opprinnelig bygget i 1634, og dens konstruksjon ble overvåket av den kinesiske munken som skulle fortsette å bli den beboende presten i Kofukuji-tempelet, som ligger en kort spasertur unna. Brua, sammen med mange av de andre langs elven, ble alvorlig skadet av flomvann i 1982, men har siden blitt reparert med gjenvunnede steiner. Det er en stein gangvei langs elvebredden som gir en hyggelig spasertur med fin utsikt over vannet og broene. Gangveien har en rolig atmosfære og nås med trinn fra gateplan plassert på forskjellige punkter langs elven.

Nagasaki Prefectural Art Museum (長崎県美術館) er et moderne museum vakkert plassert ved havnen i Nagasaki. Det ble åpnet i 2005 og har permanente Samlinger knyttet til Nagasaki, Spansk kunst og midlertidige utstillinger. Suma-kolleksjonen viser Spansk kunst fra middelalderen til moderne tid, inkludert verk av kunstnere som Picasso. Museet huser også kunstverk knyttet til Nagasaki, inkludert verk av lokale kunstnere. Et annet høydepunkt er taket hagen, med plener, sitteplasser, og utsikt over Nagasaki havn og byen. Det kan nås både fra innsiden og utenfor museet, slik at besøkende kan nyte hagen uten å gå inn i utstillingens gallerier.

Nagasaki atombombe museum (長崎原爆資料館), som ligger i nærheten av hypocenter av 9. august 1945 bombeangrep, dokumenterer ødeleggelsen forårsaket av atombomben og byen gjenoppretting. Museet har gjenstander som en smeltet rosenkrans, en klokke som stoppet klokka 11:02 og personlige eiendeler til ofrene. Gjennom fotografier, vitnesbyrd fra overlevende og utstillinger, formidler den grusomhetene ved atomkrig og fremmer fred. Fasilitetene inkluderer lydguider, et bibliotek, et videorom og barrierefri tilgang. Museet tjener som en kraftig påminnelse om konsekvensene av krig og det presserende behovet for kjernefysisk nedrustning og varig global fred.