Vannet i nærheten av Isla Contoy er veldig rik på næringsstoffer som fungerer som mat for planktonet som utgjør matbasen til mer enn 234 arter av fisk som er identifisert i området, inkludert de majestetiske hvalhaiene og stingrays som fôrer nær kysten og skilpaddene som hekker der.

Ixlaché-revet sør for Contoy markerer begynnelsen på den nest lengste revbarrieren i verden, Great Mesoamerican Reef. Det florerer vakre arter av koraller, fisk og organismer av stor kommersiell verdi, for eksempel spiny hummer og rosa snegle.
Svøm med stråler og skilpadder, sykepleierhaier og en enorm mengde fisk.